3、擴增區:主要進行DNA擴增。此外,已制備的DNA模板 (來自樣品制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑準備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。本區主要設備有:擴增儀、冰箱、離心機、加樣器等。本區的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。